Ainda nos anos de 1850, a área da Barra Funda era conhecida como  Chácara Carvalho. A região foi dividida entre  Sítio Iguape, de propriedade do barão de Iguape. 

Antigamente, a barra do rio Tietê na região era muito funda – daí o nome do bairro.  Uma parte da Barra Funda tornou-se bairro eminentemente operário, em que as epidemias de febre amarela, varíola e cólera  devido às más condições das moradias e aos frequentes alagamentos do Tietê.